董卓被吕布刺死在皇宫北掖门，朝廷又收降了董越手下的长安城防军，诛董联盟取得了长安城和朝廷中枢的控制权，汉帝刘协也摆脱了董卓集团的控制，众文武大臣脱离董卓恐怖统治。
汉帝刘协非常高兴，在随后的大朝会上任命王允录尚书事，吕布晋升为勇武将军，二人共同主持朝政。杨彪，董承，伏完，马日磾，黄琬，士孙瑞，何颙，郑泰，李肃，华歆，秦谊，陈卫十二人官升三级，俸禄翻薪。凡是参入行动的人均获得提升，加官进爵，又命令皇甫嵩带兵攻打郿坞，董旻率军在坞堡坚持抵抗。皇甫嵩领军猛攻郿坞，众士兵众将领长期生活将在董卓血腥威压之下早就受够了，唯有将董卓家人斩尽杀绝方能一泄心头之恨，万众一心，齐心协力终于将坞堡防御撕开一个口子，这时吕布率并州军增援，堡内士兵知道吕布武勇，选择放弃抵抗纷纷跪地企降。
董旻见大势已去，正转身欲逃被皇甫嵩追上斩于马下，大军继续冲杀将董卓全族男女老少杀得一干二净一个不剩，亲信部将十余人当场被杀，唯独不见董卓帐下第一谋士，鸩杀少帝的罪魁祸首李儒的身影，另外许多董卓麾下在外任职亲信部领的家属也尽数遭到屠戮，他们是自愿，或是被迫将家眷留在坞堡当中生活，这次全部遭了殃。此举日后成为西凉军从各地汇聚联合在一起的引子，又一次引发长安城的动荡。
随着董卓的身死和他留在长安的势力被肃清，长安城落入诛董联盟手中。董卓的死讯自皇宫中传出，长安城里的民众都高呼万岁，百姓在路上载歌载舞，许多人把家中仅有的钱财拿去换成酒肉来庆祝，更有大胆好事者拿着董卓尸体点天灯。董卓做梦都没想到他死了，尸首还不被人放过，真是应那句那首诗：自行不义必白毙；郿坞追魂凭李肃，宫门取命有温侯。奸雄亡于戈矛下，身作天灯死不休。
随着长安局势的稳定，朝廷短暂的恢复宁静，王允逐步掌握朝中权力，又有吕布作为后盾，逐渐在联盟中一家独大，开始暴露出他的野心。因此原本因利益纠葛联合在一起的诛卓联盟内部发生分歧，产生裂痕，最后直接解散。司徒王允掌握权柄后，以录尚书事发号政令，用追究前罪过失之名将以何颙和郑泰为首的西凉派罢官驱逐出朝堂，李肃，董承等西凉将领低调做人，在朝会之上从不会忤逆王允的决定，故而得以继续留在朝堂之中做官领兵。
王允在前董卓时期极力周旋，使汉帝少受不小的窝囊气，此次又费心劳力设计除去董卓，加之王允少年之时风评极好，刘协对他极为信任和恩宠，朝廷大事尽由其做主。王允剪除了政敌和忤逆他的朝臣，他志得意满，行事毫无顾忌，排除异己，提拔亲信，他开始体会到了权力带来的乐趣，渐渐迷失了自我，忘记初心。
王允原本出身太原王氏的旁系，他天资聪颖，独具慧质，深受长辈们的喜爱和赏识。王允自幼儿时起意气非凡，立志长大后入朝要如伊尹、霍光；入将要似卫青，霍去病。为了实现这一志向和目标，王允时时刻刻注意自身素质的修养。虽他出生豪门，但他并不贪恋奢华舒适的生活，而是充分利用家里的优越条件，饱读诗书和广阅经传。年至十七八，王允便已成为满腹经纶、学富五车的才子，令远近文人学子都对其刮目相看，习文阅经之余，王允坚持习武强身，经过长久的文修武练，渐渐成为文韬武略的全才。为官地方时，他是为民作主，不畏强暴的好父母官。为上官下属时，王允是一心一意，兢兢业业，任劳任怨。为将领兵时，他集思广益，周密部署，身先士卒，大显身手。这时候的王允还是一身正气，严于律己，宽以待人，为官尽忠职守，奉公守法，颇具君子的风范和气节。
王允作为诛杀国贼的首要功臣，王允自然少不了朝廷的奖赏和广大人民群众的称赞。他开始骄傲自满，居功自傲，打击异己，无容人之量，朝议之时乾纲独断，固执己见，不似从前那般推心置腹，谦和恭让。
昔日董卓部将李确郭汜得知董卓死讯后，上书朝廷请求赦免前罪，准许其领兵继续镇守大散关，随后许多董卓旧将上书汉帝请求朝廷免除他们的罪责，允其戴罪立功，镇守各方。刘协将这些奏书交王允全权外理，王允认为一切尽在掌握之中，这些董卓旧将不足为虑，一群丧家之犬不足为惧，要求李确郭汜交出兵权，兵马由朝廷派人接手统领，尽缚双手至长安请罪，语气强横言辞激烈。对于其他人的请愿奏书王允的回复，依旧是交出兵权，到长安请罪。
士孙瑞，皇甫嵩，杨彪，黄琬四人急忙规劝王允收回成命，三思而后行，建议王允缓兵而行，先答应他们继续留在原地统兵，然后再诓其入长安，问罪。或者赦免一部分，问罪一部分，使这些人相互制衡，不敢轻举妄动。然而王允认为他们的作法有失朝廷威严，同时认为连不可一世的董卓都被他搞死了，这些人还不是手到擒来，乖乖受缚于是他一意孤行，坚持己见的发出了自己的命令。
当李确，郭汜，张济，樊稠收到王允代表朝廷的回复，气得破口大骂。原本他们是想有条活路，不想与朝廷为敌，选择放下在郿坞之中亡父灭母之仇，杀妻害子之恨。王允的回复，朝廷强硬的态度，彻底断绝了他们的活路。如果他们按照朝廷去做，自知以往所犯罪行足够他们死几十回的，在生死攸关面前，他们十分害怕，第一想法就是迅速逃跑，竟然忘了他们手握几万精兵完全可以反戈一击，对王允反攻倒算，当他们收拾物品准备连夜私自跑路时，被谋士贾诩拦住了，在逃亡至大散关的何颙、郑泰建议下他们放弃弃军私逃避祸的想法，认为全力出击，攻入长安，拿捏皇帝，处死王允，比私逃企活更好。他们决定放手一搏，紧急联合所有人组成联军，反攻长安，胁持汉帝，掌握朝政。紧急协商过后由驻守萧关的牛辅为联军主帅，率领李确，郭汜，张济，樊稠四人及其手下西凉士卒共计十五万人，打出为董卓复仇，为亲人家属报仇的旗帜，起兵攻向长安，平静不到一个月的长安再次动荡起来了。
联军东西两路同时出发，牛辅和李确郭汜为西路军，从大散关进军；张济樊稠为东路系，从武关进攻，一路上所向辟利，他们每个人却抱有必死之决心戮力向前，他们明白长安朝廷不会放过他们这些人的，他们要么死在冲锋的路上，要么死在逃亡的路上，要么攻入长安获得生路。联军所过之处关中大地开始动荡不安起来，各地将紧急文书送往长安。
当得知十几万大军要兵围长安的消息，王允这才知道狗急跳墙的道理，十分后悔当初刚愎己用的决定，朝中大臣很不满王允这些日子的做法，但紧急关头还是无条件支持他，因为大家是一根绳上的蚂蚱，如果长安城破，他们也要跟着遭殃了，李确郭汜是不会给好果子给他们吃的，纷纷放下诚见恩怨，积极想办法应对。派吕布至右扶风御敌，派皇甫嵩到左冯翊高陵阻击东边而来的军队。
当吕布到右扶风，派同乡李肃担任先锋迎牛辅李确郭汜三人七八万大军。李肃所领三万之军乃是收降的原董卓帐下西凉军卒，刚与李确郭汜一接触许多人立马倒戈，杀向李肃先锋中军，这些人原本就是吃人不吐骨头的恶狼，董卓死后他们不得不变成听话的绵羊收起往日的嚣张跋扈，早就憋着火气，现在正是转换阵营，调转枪头的时候。李肃奋力拼杀，杀一条血路孤身一人逃回到吕布面前，吕布非常看不起靠钻营上位们李肃，李肃为升官花言巧语劝吕布杀丁原投董卓，又因久不得迁，怨恨董卓不识人才，既而与王允勾结谋杀董卓。吕布对李肃也是十分痛恨的，如果不是他自己怎么会被人称为三姓家奴，李肃兵败，吕布杀心顿起，可怜李肃刚刚死里逃生，现在尸首分离，被吕布一剑两断，死于非命。
李确郭汜得到三万倒戈的西凉降兵，兵力增至六万，连同牛辅的四万兵共计十万人，他们浩浩荡荡向驻守在右扶风县城的吕布发起进攻，吕布率领并州铁骑出城，双方在右扶风城下展开大战，并州铁骑面对一帮亡命之徒，双手浸染鲜血的屠夫，终究寡不敌众节节败退，吕布双拳难敌四手，只得弃城而逃。
随后牛辅、李确、郭汜率军进入右扶风城，大摆庆功宴，席间牛辅对李确、郭汜指手画脚，令得他们十分不满，宴会过后李确，郭汜凑在一起密谋，他们轻松击败吕布，现在两人手中兵力超过牛辅，让他们自信心暴棚，不该有的想法也暴露出来了，两人不甘心为他人作嫁衣，找个爹总供着压自己等人一头，决定晚上密密杀死牛辅，平分他手下的兵马，将来入主长安两人共同执掌朝廷，做大王。思想决定行动，深夜牛辅稀里糊涂的丢了性命，李确郭汜又一顿忽悠很安抚接管了牛辅手下的军队。
西边吕布军战败弃城而逃，东边皇甫嵩对应张济，樊稠两路大军，两方在左冯翊对战，老将皇甫嵩死于张济侄子张绣手下，张绣素有北地枪王之称，是枪神童渊的徒弟，也是赵云师兄。皇甫嵩死后缺乏训练，由各家家丁护卫组成的军队如何挡得住如狼似虎的西凉兵，不久之后迅速逃散。
右扶风、左冯翊相继被董卓余孽占领，长安东西失去最后的凭障，长安朝廷动荡不安，长安城在西凉兵峰之下及及可危。长安城里仅有白两支军队均已宣告失败，门户大开，胡轸复叛引董卓旧将李傕、郭汜，张济，樊稠迅速占领长安，杀死王允，控制皇宫，掌握政权。汉皇、长安再一次陷入西凉魔爪当中，大汉政权落入了李确、郭汜这两人手中，如果说董卓是大汉的掘墓人，那么李傕、郭汜就是大汉的催命鬼。